Lansoprazole có thể làm thay đổi sự chuyển hóa của thuốc chuyển hóa qua CYP450 (như warfarin, antipyrin, indomethacin, ibuprofen, phenytoin, propranolol, prednison, diazepam, clarithromycin); kéo dài thời gian thải trừ của diazepam, phenytoin, warfarin; tăng nhẹ độ thanh thải của theophyllin; giảm sự hấp thu của thuốc hấp thu phụ thuộc pH acid dịch vị (như ketoconazol, itraconazol). Voriconazol: nồng độ của hai thuốc đều tăng, nên giảm liều lansoprazole. Thuốc kháng acid, sucralfat: làm giảm sinh khả dụng của lansoprazole, tránh dùng trong vòng 1 giờ sau khi dùng lansoprazole.